Okulumuz Öğretmen Lisesi olarak 1994/1995 eğitim öğretim yılında Zihni Derin Ortaokulu ek binasında geçici olarak öğretime başlamıştır. 1999 yılı Aralık ayında geçici kabul ile bu günkü binasına taşınmış, kesin kabulü 2002 yılında yapılmıştır.

Okulumuz 2014 yılında Anadolu lisesine dönüştürülmüş ve Engindere Anadolu Lisesi adını almıştır. 2015 yılında Fatih Anadolu  lisesi adını almıştır. 2020-2021 Öğretim yılında proje okulu olmuştur.

2000 yılında  erkek pansiyonu açılmıştır. Fiziki şartların değişmesi üzerine pansiyon kapasitesi 75 Erkek öğrenci olarak belirlenmiştir.